Position Ref ARG1 ARG2 ARG3 ARG4 BAL3 BAL73 BAL9 C22 C23 C24 C25 C26 C27 C28 C30 C31 C32 C33 C34 CDC GHA1 GRA1 GRA2 HAIB IND1 IND2 IRAB N12 N13 N14 N15 N16 N17 N18 N19 N20 N21 NIC1 NIC2 PhiL1 S1 S10 S11 S12 S13 S14 S15 S16 S17 S18 S19 S2 S3 S4 S5 S6 S7 S8 S9 SAM1 SEA86 SPA1 SRR2996724 SRR2996725 SRR2996726 SRR2996727 SRR2996728 SRR2996729 SRR2996730 SRR2996731 SRR2996732 SRR2996733 SRR3054906 SRR3571774 SRR3571775 SRR3571776 SRR3571778 SRR3571783 SRR3571785 SRR3571786 SRR3571794 SRR3584837 SRR3584838 SRR3584839 SRR3584840 SRR3584841 SRR3584842 SRR3584843 SRR3584844 SRR3584845 SRR3584871 SRR3584875 SRR3584879 SRR3584882 SRR3584884 SRR3584886 SRR3584962 SRR3584965 UK1 UK2 UK3 UK4 UK5 UK6 UW1 UW2 X %X A T G C 223 G . . . . . . . . N N N N . N N N N . N . . N . . . . . . . . . . . N . . N . . . . N N N . N . . . . X . N . C . X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . X C N . N N . . 4 3.77358490566038 0 0 0 2 224 A . . . . . . . . N N N N . N N N N . N . . N . . . . . N . . . . . N . . N . . . . N N N . N . . . . X . N N C . X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . X C N . N N . . 4 3.77358490566038 0 0 0 2 254 T . . . . . . N . N N N N . N N N N . N . . N . . . N N N N . . N . N N . C . . . . N N N . N . . . N X . N N N . X . C . . N . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N C N . N N . . 2 1.88679245283019 0 0 0 3 259 G . . . . . . N . N N N . . N N N N . N . . N . N . N N N N . . N . N N . N . . . . N N N . N . . . N N N N . N . X . A . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N A N . N N . . 1 0.943396226415094 2 0 0 0 521 A . . . N . . . N N N N . . N N N N . X . . N . . . . N . . . . N . N . . X . . . . N N N . N . . . N . N N X G X X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 6 5.66037735849057 0 0 1 0 761 G . . . . . . X . N N N . . N N N N . . X A N . N A X X . . . . N . N . . N . . . . N N N . N . . . N . . N . N . . . N A . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N . . . 4 3.77358490566038 3 0 0 0 852 G . . . . . . . . N N N . . N N N N . . . . . . . . . . . . . . N . N . . N . . . . N N N . A . . . X X . N N N . . . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 3 2.83018867924528 1 0 0 0 900 C . . . . . . . . N N N . . . N N N . N . . N . . . N N . . . . N . N . . N . . . . N N N . T . . . X N . N . N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 1 0.943396226415094 0 1 0 0 902 G . . . . . . . . N N N . . . N N N . N . . N . . . N N . . . . N . N . . N . . . . N N N . A . . . X N . N . N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 1 0.943396226415094 1 0 0 0 903 T . . . . . . . . N N N . . . N N N . N . . N . . . N N . . . . N . N . . N . . . . N N N . C . . . X N . N . N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 1 0.943396226415094 0 0 0 1 925 G . . . . . . N . N N N . . . N N N . N . . N . . . N N . . . . N . N . . N . . . . N N N . A . . . N N . N . N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 0 0 1 0 0 0 1094 G . N N . . . N . N N N . . N N N N . N N . N . . . N N . . . . . . N . . N . . . . N N N . A . . . N N . N N N N N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 0 0 1 0 0 0 1099 G N . N N . . N . N N N . . N N N N . N N . N . . . N N . . . . . . N . . N . . . . A N . . X . . . N . . N N N N N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 1 0.943396226415094 1 0 0 0 1159 G N . N . . . . . N N N . . N N N N . N N . N . . . . N . . . . N . N . . N . . . . X N N . A . . . . . . N N N N N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 1 0.943396226415094 1 0 0 0 1163 A . . N . . . . . N N N . . N N N N . N N . N . . . N N . . . . N . N . . N . . . . X N G . N . . . N . . N N N N N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 1 0.943396226415094 0 0 1 0 1912 C N . . . . . N . N N N . . N N N N . N . . N . . . N . . . . . N . N . . N . . . . G N N . X . . X N . . N . N N N . N . . N . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 2 1.88679245283019 0 0 1 0 1915 A . . . N . . N . N N N . . N N X N . N N . N . . . N . . . X N N . N N . N . . . . G N N . X . . X X N . N X N X N . N . . N . . . . . . . . . . . . N . . . . X . . N . . . . . . . . X . . . . . N N G N . N N . . 9 8.49056603773585 0 0 2 0 1917 C X . . X . . N N N A N . . N N X N . N N . N . . . N N . . X N N . N X . N . . . . A N N . A . . N N X N N X N X N . N . . N . . . . . . . . . . . . N . . . . X . . X . . . . . . . . X . . . . . X N A N . N A . . 12 11.3207547169811 5 0 0 0 1919 C . . . N . . N . N G N . . N X X N . N N . N . N . N N . . X . G . N N . N . . . . N N . N X . . X X X . N X N X N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . X . . . . . . . . . . . . . . . . . X N X N N . . . . 12 11.3207547169811 0 0 2 0 1921 T N . . . . . N N C . N N . N X . N . X N . N . . . N N . N . . . . N . . C . . . . X N X N X . . . N N X N N C N X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . N N N N X X . . 10 9.43396226415094 0 0 0 3 1923 G . . . . . . N N N . N N . . . . N . N N . N . . . N N . N . . . . N . . T . . . . . N X . . . . . . N X . N X . X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N X . . 6 5.66037735849057 0 1 0 0 1924 A . . . . . . N N N . N N . . . . N . N . . N . . . N N . N . . . . N . . G . . . . . N X . . . . . . X X . N X . X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N X . . 7 6.60377358490566 0 0 1 0 1927 T X . . . . . N . . . N . . . N . N . X . . N . . . N N . . . . . . N . . N . . . . . N N . . . . . . . C X . . X N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . N . . . . . 4 3.77358490566038 0 0 0 1 1936 A . . . N . . N N N N N . . N X X N N X . . N . . . N N N . N . N . N X . N . . . N N N . . . . . N N N G . . X . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . X . . . . . . . . N N . . . . . N N N . X N . . 7 6.60377358490566 0 0 1 0 2003 C N X N X . N N X X X N X N X X X N X X N . N . N . N N X N X X X X T X . T . . . X X N X X X N N X X X T X X X N X X X . N N . . . . . . . . . . . N . . . . . X X . X . . . . . . . . . N . N . . X T X X X X T N N 39 36.7924528301887 0 5 0 0 2014 T X N . . . . N X C N N X . N N . N N N N . N . . . N N X N . . N N X N . N . . . . N N C N X . . . N N C X X X X X N X . N N . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . N . N N X N X X C . N 15 14.1509433962264 0 0 0 4 2022 C . . . . . . N . N N N N . . X T N . . N . N . . . N N . N . . . . N X . N . . . . N N N . N . . . N . X N . . N X . X . . N . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . X . . . . . . . . . . . . . . . N . . N N . . N 6 5.66037735849057 0 1 0 0 2028 A N . . . . . . . N X N N . N G X N N X N . N . . . . N N N N . N . N X . N . . . . X N N . X . . . X N . N N N X N . X . . N . . . . . . . . . . . . N . . . . X N . N . . . . . . . . . N . . N . X N X N . N N . . 12 11.3207547169811 0 0 1 0 2038 G N . . N . . . . N N N . . N N N N N N . . N . . . . . N N . . . . N X . N . . . . A N N . A . . N X N . N N N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . X . . . . X . . X . . . . . . . . . N . . . . . N X N . N N . . 6 5.66037735849057 2 0 0 0 2042 C . . . N . . . N N N N . . N N N N . N . . N . . . . . . . . . . . N . . N . . . . A N N . X . . . . N . N . N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . X . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 2 1.88679245283019 1 0 0 0 2062 G . . . N . . . N N N N . . N N N N . . . . N . . . . N . N . . . . N X . N . . . . N N N . A . . . X . . N . N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . N N . . N N . . 2 1.88679245283019 1 0 0 0 2099 A N . . . . . . G N N N . . N X N N G X . . . . . . . . G G G G N G N X G N . . . G N N N G X G G G X X G N X N G N G N . . N G G G G G G G G G G G . X G G G G . G G X G . . G G G G G G G G G G G G N N N G N N X . 10 9.43396226415094 0 0 47 0 2100 A . . . . . . . . N N N . . N . N N . . . . . . . . . . . . . . N . N . . N . . . . N N N . . . . . . . . N . N . . . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . G 0 0 0 0 1 0 2503 T N N . N . . N N N N N . . N N C N . . . . N . . . . N N . N . . . N X . X . . . . C N X . X . . . X N X N X N C X . N . . N . . . . . . . . . . . . N . . . . N . . X . . . . . . . . . . . . . . . N X N N N N . . 10 9.43396226415094 0 0 0 3 2516 T X . . . . . N N N N N . . N . X N . . . . N . . . . N . . N . . . N N . N . . . . X N N . X . . . X N . N N N . X . C . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . N . N X N N N X . . 8 7.54716981132076 0 0 0 1 2528 G . . N . . . N N N N N N . N . . N . . . . N . . . . N N . . . . . N N . X . . . . . N C . . . . . . X . X N X . X N X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . N X N N X X . . 9 8.49056603773585 0 0 0 1 2531 A X . N N . . N N N N N . . N X G N N X . . N . . . . N X N X . X . N X . X . . . . G N N N G . . N G X X X X N G X N N . . N . . . . . . . . . . . . N . . . . X . . X . . . . . . . . X N . N . N N N X N N X N . . 18 16.9811320754717 0 0 5 0 2558 G . . N . . . N N X X N N . X X . N N N N . N . . . N N X N . . . . N N . X . . . . X X X N N . . X X X A X N X . N N N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N X N X X N . N 17 16.0377358490566 1 0 0 0 2572 A N . N N . . N N X G N N . X X X N . X N . N . . . N N X N X N X N N X . X . . . N X X G N X . . N X X . N X X N N N X . . N . . . . . . . . . . . . N . . . . X . . X . . . . . . . . N N . N . N . N N N N X N . . 21 19.811320754717 0 0 2 0 2575 C X . N . . . N . N N N N . N . X N N X N . N . . . N N . . . N X . N X . . . . . N X X N . X . . X X X T X N X X N . N . . N . . . . . . . . . . . . X . . . . X . . N . . . . . . . . N . . . N N N N N . N X . . . 17 16.0377358490566 0 1 0 0 2589 T . . N . . . N N . . N . . . N X N . . N . N . . . N N N N X N . . N N . N . . . . X N . . N . . N . N A . X N . X N X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . N N . N . . . . . . . . . . . N . N . N X N N . . . N 7 6.60377358490566 1 0 0 0 2590 T X . N . . . N N . N N . . N N X N . X N . N . . . N N X N . N X . N N . X . . . N X X N . X . . N X X . N X X G X N X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . X . . N . . . . . . . . N N . . N . . N X N N X X . . 19 17.9245283018868 0 0 1 0 2602 A C . . N . . N N . X N N . N X X N . X N . N . . . N N X N . N X . N N . X . . . N X N G . X . . N X X . N X G C X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . X . . N . . . . . . . . N N . . N . . N X N N X X . . 18 16.9811320754717 0 0 2 1 2617 T X . . . . . N N . N N . . . X C N . X N . N . . . N N X N X N . . N X . . . . . . X N . . X . . N X X C X X N C N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . X . . X . . . . . . . . N N . N N . . N X N N X N . . 16 15.0943396226415 0 0 0 3 2638 C X . . . . . N N . X N . . N X T N . X N . N . . . N N X N N . X . N X . X . . . N T N T N T . . X X X X T X T T X N T . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . X . . X . . . . . . . . N N . N . . . N T N N T T . N 16 15.0943396226415 0 11 0 0 2648 C . . . . . . N N T N N . . N . . N . . . . N . . . N N . . . . . . N . . X . . . . . N N N . . . . . N . N . N . X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N X N N N X . . 5 4.71698113207547 0 1 0 0