Position Ref ARG1 ARG2 ARG3 ARG4 BAL3 BAL73 BAL9 C22 C23 C24 C25 C26 C27 C28 C30 C31 C32 C33 C34 CDC GHA1 GRA1 GRA2 HAIB IND1 IND2 IRAB N12 N13 N14 N15 N16 N17 N18 N19 N20 N21 NIC1 NIC2 PhiL1 S1 S10 S11 S12 S13 S14 S15 S16 S17 S18 S19 S2 S3 S4 S5 S6 S7 S8 S9 SAM1 SEA86 SPA1 SRR2996724 SRR2996725 SRR2996726 SRR2996727 SRR2996728 SRR2996729 SRR2996730 SRR2996731 SRR2996732 SRR2996733 SRR3054906 SRR3571774 SRR3571775 SRR3571776 SRR3571778 SRR3571783 SRR3571785 SRR3571786 SRR3571794 SRR3584837 SRR3584838 SRR3584839 SRR3584840 SRR3584841 SRR3584842 SRR3584843 SRR3584844 SRR3584845 SRR3584871 SRR3584875 SRR3584879 SRR3584882 SRR3584884 SRR3584886 SRR3584962 SRR3584965 UK1 UK2 UK3 UK4 UK5 UK6 UW1 UW2 250 A N . N N . . N N N N N . . N T N N . N N . N . N . N N N . . . . . N N . N . . . . N N N . X . . . . N . N X N X N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . N 3 0.028301886792453 0 0 1 0 254 G N . N N . . N N N N N . . N X N N N N N . N . N . N N N . . . . . N N . N . . . N N N N . C . . . X N . N X N N C . C . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . N 3 0.028301886792453 0 3 0 0 271 A X . . N . . N N N N N N . N C . N . N N . N . N . N N N . . . . . N N . X . . . N X N N . X . . . . N N N X N X C . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N X N N N N . N 8 0.075471698113208 0 2 0 0 301 C . . N . . . N . N N N . . N N N N . N N . N . N . N N . . . . . . N . . N . . . . X N N . T . . . N N . N . N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . N 1 0.009433962264151 0 0 1 0 484 C N . N N . . N . N N N . . N N N N . N N . N . . . N N . . . . N . N N . N . . . . G N N . N . . . N . . N N N N N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . N 0 0 0 0 0 1 499 T N . . N . . N . N N N . . N N N N . N N . N . N . N N N . . N N . N N . N . . . . C N N . N . . . N . . N . N N N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . N 0 0 0 1 0 0 692 A . . N . . . . . N N N . . N A N N . N N . N . N . N N . . . . . . N . . N . . . . N N N . N . . . N N . N . N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 0 0 1 0 0 0 724 T . . N . . . N . N N N . . N N N N . N . . N . N . N N . . . . N . N . . N . . . . N N N . N . . . N N X N N N N A . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N X N N N N . . 3 0.028301886792453 1 0 0 0 834 C N . N N . . N N N N N . . N N N N N N N . N . N . N N N . . . N . N N . N . . . . X N N . X . . . N N . N N N X N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N C N N X N . . 4 0.037735849056604 0 1 0 0 843 T . . N N . . N . N X N . . N X N N . . N . N . N . N N N N X N N . N N . N . . . . X N N . X . . X C N . N X . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . N X N N N . . . 8 0.075471698113208 0 1 0 0 844 T N . N N . . N N N X N N . N G X N N X N . N . N . N N N N X N N . N X . N . . . . X N N . N . . X G X X N X N X X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . N N X N N N N . . 14 0.132075471698113 0 0 0 2 845 G X . N N . . N N N N N N . . N X N . X N . N . N . N N X . . N N . N N . X . . . . N N N N N . . . . N X N N X X X N X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . N X N N N T . . 11 0.10377358490566 0 0 1 0 847 T . . N N . N N . N N N . . . . . N . N N . N . N . N N . N . . N . N . . N . . . . . N A N . . . . . N A N N X . X N N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N X X N X X . . 6 0.056603773584906 2 0 0 0 857 G . . N N . . N N . . N . . . . . N . N N . N . N . N N N . . . . . N . . . . . . . . N . . . . . . . . T . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . N N . . . . 0 0 0 0 1 0 884 T N N N X . . N . N X N . . X X X A N X N . N . N . N N . X X N X . N X . . . . . . X N N N X . X X A X . . X N . N . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . X X . . . . . . . . . . N . . . . . N N X N . X . . . 20 0.188679245283019 2 0 0 0 888 G N N N X . . N N N X N N . X X X X . . N . N . N . N N N X X N X N N X . X . . . . X N . . X . X X A X . N X X . X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . N X . . . . . . . . . . N . . . . . N N X N . X X . . 24 0.226415094339623 1 0 0 0 908 G N . N . . . N N N . N N . . N X . . . N . N . N . N N N . . . . . N . . N . . . . N N N . . . . . . . C N N N X X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 4 0.037735849056604 0 1 0 0 909 A N . N . . . N N N . N . . . N N . . . N . N . N . N N N . . . . . N . . N . . . . N N N . . . . . . . A N N N X X . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 2 0.018867924528302 1 0 0 0 916 C N . N . . . N . N . N . . . . N . . . N . N . N . N N N . . . . . N . . N . . . . . N N . . . . . . . A N N N X X . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N . N . . 2 0.018867924528302 1 0 0 0 931 A N . N X . . N . N C N . . X N N N . X N . N . N . N N . N N . X . N X . N . . . . C N N . N . . X N N . N X N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . N N . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 7 0.066037735849057 0 2 0 0 936 C N . N N . . N . N N N . . N N N N . N N . N . N . N N . . N . . . N . . N . . . . X N N . A . . N N N . N N N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 1 0.009433962264151 1 0 0 0 1017 G N . N . . . N N X N X X . N X X N N X N . N . . . N N X N N N X N N X . X . . . N X N T X X . . N N X T T X T T T X T . N N . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . N T X N T X . N 18 0.169811320754717 0 0 9 0 1018 G N . N . . . . . . N . . . N . . N . . N . N . . . N N . . . . . . N N . . . . . . . N . . . . . . N . T . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . N . . . N 0 0 0 0 1 0 1023 A N . N . . . . . . N . . . N . . N . . N . N . N . N N . . . . . . N N . . . . . . . N . . . . . . N . A . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . N . . . N 0 0 1 0 0 0 1024 A N . N . . . N N X N X X . N X X N N X N . N . N . N N X N X N X N N X . X . . . N X N A X X . . N N X A A X A X A X A . N N . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . N A X N A A . N 19 0.179245283018868 9 0 0 0 1057 A N . N . . . N N N N N . . N N N N . N N . N . . . N N N . . . N . N . . X . . . . N N N . X . . . N N X N N N X N . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N T N N N T . . 5 0.047169811320755 0 0 2 0 1162 T N . . N . . . . N N N . . N N N N . N N . N . N . N N . . . . . . N N . N . . . . X N N . T . . . N . X N N N X X . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 5 0.047169811320755 0 0 1 0 1260 G . . . . . . N N N N N . . N N N N . N . . N . N . N N . . . . N . N . . N . . . . C N N . N . . . N . X N . N . N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 1 0.009433962264151 0 1 0 0 1320 C N . N N . . N N N N N N . N N X N . N N . N . N . N N . . . . N . N X . N . . . . X N N . N . . . N . X N N N X A . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N A N N N N . . 6 0.056603773584906 2 0 0 0 1321 G N . N N . . N N N N N N . N N C N . X N . N . N . N N . . . . N . N X . N . . . . X N N . N . . . N . X N X X X C . X . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N C N N N N . . 8 0.075471698113208 0 3 0 0 1357 A N . N N . . N N N N N N . N N N N . N N . N . N . N N . . . . N . N . . N . . . . C N N . N . . . N . . N N . X . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 1 0.009433962264151 0 1 0 0 1358 G N . N N . . N N N N N N . N N N N . N N . N . N . N N . . . . N . N . . N . . . . G N N . N . . . N . X N X X N X . G . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 4 0.037735849056604 0 0 0 2 1359 A N . N N . . N N N N N N . N N N N . N N . N . N . N N . . . . N . N . . N . . . . A N N . N . . . N . X N N X . X . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N N N N . . 3 0.028301886792453 1 0 0 0 1430 T N . N N . . N . N N N N . N N N N N N N . N . . . N N . . . . N . N . . N . . . . X N N . T . . . N N . N X N X N . N . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 3 0.028301886792453 0 0 1 0 1431 T X . N N . . N . N N N N . N N N N . N N . N . . . N N N . . . N . N N . N . . . . G N N . G . . . N N N N X N X N . G . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N N N . N N . . 3 0.028301886792453 0 0 0 3 1459 T T . N N . . N N N T N N . N X X N . X . . N . N . N N X N . N N N N X . X . . . N X N T X X . N N X T N T X T X T N T . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N X N N T X . N 14 0.132075471698113 0 0 9 0